2000年11月9日重庆市涪陵银科经济技术信用担保有限公司成立，注册资金1000万元。

2004年，涪陵区成为国家开发银行重庆市分行中小企业贷款首批试点区县,公司作为其中的运作平台开始正式介入担保行业。

2007年6月，公司更名为重庆市涪陵区银科信用担保有限责任公司，当地政府用国有资产转让收入对担保公司专项增资到5000万元。同年8月，涪陵区政府与重庆市三峡库区产业信用担保有限公司签订了《产业项目贷款联保、再担保合作协议》，先由当地政府增资到了1亿元，年末三峡担保公司参股1000万元。

2008年，公司当选为重庆市担保协会常务理事单位。

2009年1月，公司1.1亿元注册资金增资请示得到了国家工信部的行政许可，成为区县第一家资本金上亿而得到国家主管部门行政许可的担保机构。

2010年，银科担保公司成为重庆市首批获得经营许可证的担保公司。

2012年12月8日涪陵区政府与重庆兴农融资担保集团有限公司于签署了《战略合作协议》。

2013年4月，由原股东重庆市涪陵国有资产投资经营集团有限公司出资3500万元，新股东重庆兴农融资担保集团有限公司出资500万元将银科担保公司注册资本增加到了15000万元。2014年，市兴农担保集团受让三峡担保集团1000万元股份。

2014年4月，公司更名为重庆市涪陵区银科融资担保有限责任公司

2014年末，公司接入人民银行征信系统。

2015年8月末月，公司网站（http://www.cqyinke.com/）正式上线。

2015年，公司OA系统开发完成。

2016年，公司连续第三年被市中小企业局授予“支持中小企业发展成长型担保机构”称号，同年被重庆市融资担保协会授予“副会长单位”称号。

2016年3月，公司首笔2000万元工程履约担保项目落地，开始介入非融担保领域。

2016年9月，股东重庆市涪陵水利电力投资集团有限公司将持有银科担保公司3100万元股份划转至重庆市涪陵国有资产投资经营集团有限公司。

2017年4月26日，公司向涪陵区人民法院开立了公司首笔诉保全担保保函。

2017年5月25日，公司成为中国融资担保业协会会员单位。

2017年，公司首批扶贫小额贷款“带资入股”模式项目落地，首笔汽车分期贷款项目担保落地，首笔“母亲创业循环金”小额扶贫贷款担保项目落地，推进金融创新支持小微三农发展步入快车道。

2018年2月24日，重庆涪陵电力实业股份有限公司将持有银科担保公司500万元股份划转至重庆市涪陵国有资产投资经营集团有限公司。

2018年6月，股东国投集团出资5000万元，公司增资到2亿元。

2019年10月10日，重庆市市人大常委会调研组对公司担保支持“小微”“三农”、服务地方经济发展等情况进行现场调研。

2019年12月20日，公司首笔“农民工工资保证金”履约担保项目落地。

2019年1月，公司搬迁至新办公室。

2019年3月，公司宣传片拍摄完成。4月，公司宣传片正式出炉。

2020年，公司出台多项政策支持涪陵区中小微企业在疫情期间度过难关。重庆市金融监管局在专题视频调研中对公司精准施策、履行责任担当予以高度肯定。

2020年3月，公司获得涪陵区妇联授予的涪陵区巾帼文明岗荣誉称号。

2020年5月，银科担保公司首笔低价风险担保履约担保和首笔先予执行担保项目落地。

2020年6月，公司成为重庆市首家获批“重庆市科技型企业”的区县担保机构。

2020年6月，公司被纳入重庆市首批（34家）政府性融资担保机构。

2020年11月，为推动成渝双城经济圈建设，公司四川坤泰担保公司签署了《助推成渝双城经济圈建设战略合作协议》，成为全市担保行业首家。

2020年11月，公司首笔“三融贷”担保项目落地，首次实现“政银担”风险分担。

2021年2月，公司成为全市首批换发新的《融资担保业务经营许可证》的担保公司。

2021年5月，公司参加“川渝融资担保行业服务成渝地区双城经济圈建设集中签约及交流座谈会”并与四川坤泰担保公司签约。

2021年7月，公司拍摄的《金融支持小微企业发展》微视频获全区一等奖。

2021年10月，公司与重庆兴农融资担保集团有限公司合作开展的首笔投标保证金电子保函业务落地。

2021年10月，公司与三峡担保、兴农担保开展电子保函业务。

2021年10月28日，公司与市再担保公司签署了《比例再担保合作协议》，加入全市政府性融资担保体系。

2021年12月30日，公司与市再担保公司、市农担集团签署了《战略合作签约》。